弥生時代、人は入れ替わったのか——「日本人のルーツ」はどこまでわかっているのか

山口県の西のはずれ、響灘に面した砂丘に、土井ヶ浜という遺跡がある。

そこから掘り出された人骨は、背が高く、顔が縦に長い。同じ列島の、それより古い時代の人骨とは、見た目からして違っていた。海の向こうから来た人たちではないか。 20世紀の研究者たちがそう考えたのは、無理のないことだった。

2024年、そのうちの1体——およそ2,300年前の人物のゲノムが読まれた。結果は、東アジア系と北東アジア系の両方の成分をもつ集団が朝鮮半島から渡り、縄文人と混血したというものだった。

来た人がいた。そして、混ざった。

いま確かなことから始めると、そこになる。

「置換か、伝播か」という問いが、そもそも間違っている#

長いあいだ、この話は二択で語られてきた。人が入れ替わったのか、それとも稲作という技術だけが伝わったのか。

古代ゲノムの解析は、その二択を崩した。

新たに解読された12体の古代人ゲノムを分析した研究は、弥生時代の農耕への移行を、置換ではなく同化の過程として描いている。渡来した集団と在来の集団の遺伝的な寄与は、ほぼ同等だったとされる。ただしこれは一説の段階で、議論は続いている。

入れ替わったのでもなく、技術だけが来たのでもない。混ざった。 それが、いまいちばん確からしい像である。

いま、どのくらい「縄文」が残っているのか#

では、混ざった結果はどうなったか。

Biobank Japan の約25万人という規模の解析では、現代日本人の祖先が縄文・北東アジア・東アジアの三層構造をもつことが確認されている。そして北海道と琉球では、縄文由来の割合が高いと考えられている。

具体的な数字もある。全国7地域・3,200人超の全ゲノム解析では、縄文由来成分の推定割合は沖縄で28.5%、西日本で13.4%と報告されている※1。

ただし——この数字は、そのまま受け取ってはいけない。

すべて推計である。手法が変われば動く。地域の区切り方でも動く。「日本人の◯割は渡来系」という言い方が一人歩きするとき、落ちているのはこの但し書きのほうだ。

だからこの記事では、数字を単独では使わない。使うときは、手法と幅をセットにする。

「たくさん来た」とは限らない#

ここからが、この話のいちばん面白いところである。

現代人に渡来系の成分が多い。だから大量に渡来したのだろう——と考えたくなる。実際そう考えられてきた。埴原和郎が1991年に提唱した二重構造モデルでは、渡来人の規模は最大100万人に及ぶ可能性があり、7世紀末までに列島人口の70〜90%を渡来系が占めうるとされた。長く有力な見方だった。

ところが、これは算数で崩れる。

初期の人口が小さくても、増加率にわずかな差があれば、数百年で構成比は逆転する。 複利と同じである。年利1%と2%の差が、100年後には倍以上の開きになるように。

農耕は、狩猟採集より多くの人を養える。人口を養う力に差があれば、増加率にも差が出る。すると、最初に渡ってきたのが少人数でも、時間が構成比を作り変えてしまう。

九州北部の弥生文化の成立について、「男性の1割が渡来人であれば人類学的に説明できる」という中橋孝博の見解が、藤尾慎一郎によって紹介されている※2。

この見方はまだ生きている。それを殺す証拠が、まだ出ていないからだ。 弥生の早い時期の北部九州の人骨ゲノムが多数得られて、初期の段階からすでに渡来系の成分が高頻度だとわかれば、この説は死ぬ。いまのところ、そのデータはない。

「三層」で一致していても、三層目が何かでは一致していない#

もうひとつ、研究の現場で起きていることを書いておきたい。

現代日本人の祖先が三層構造をもつ——ここまでは、複数の大規模研究が一致している。ところがその第三層が何を指すかで、指す方向が違う。

2021年の研究は、古墳時代（3〜7世紀）の東アジア系の後期流入を第三層とした。一方、2024年の研究は、東北日本に濃縮する「古代エミシに関連する」成分を第三の成分としている※1。

同じ「3つ」でも、指しているものが違う。構造の数だけが一致していて、中身が一致していない。 学界が混乱しているというより、まだ像が結ばれていないということだ。

ここから先は、まだわかっていない#

第三層が何なのか、決まっていない。 研究によって指す方向が違う。

動くとしたら——2つの研究が、同じ地域・同じ時期の人骨を、同じ数だけ読んだときである。 いまは片方が古墳時代を見て、もう片方が東北日本を見ている。見ている場所が違うのに、 同じ「第三層」の名で呼んでいる。 重なる試料で比べられれば、同じものなのかどうかが決まる。

最初に渡ってきた集団の規模も、わかっていない。 少数が来て増えたのか、大規模に来たのか。現代人の構成比からは決められない。 混血してから現代までの2,000年に、偏った繁殖成功も、地域間の移動も、近世以降の人口移動も挟まっているからだ。

弥生時代がいつ始まったのかさえ、確定していない。 国立歴史民俗博物館がAMS炭素14年代測定に基づき、開始を約500年さかのぼらせる年代観を示した。ただし福岡市博物館の解説は「この年代観に関してはまだ確定したものではありません」と明記している※3。年代が動けば、「どのくらいの速さで起きたか」の議論は全部動く。

動くとしたら——同じ遺跡の複数の試料で測定が重ねられ、土器の型式との対応が動かなくなったときである。1点の測定値は、それ単独では年代観を決められない。

これらは「まだ調べていない」のではない。調べる材料そのものが、まだ足りていない。

とくに足りないのが2つ。朝鮮半島南部の同時期の古代ゲノムと、弥生の早い時期の西日本の人骨のゲノムである。渡来元がわからないまま、渡来の規模を論じているのが現状だ。この2つが出れば、上の3つはかなり決まる。逆に言えば、それまでは誰にもわからない。

そして、この問い自体が新しい#

最後に、少し引いた話をしたい。

「単一民族」という自画像は、戦後に一般化したものである。 戦前の日本人起源論の主流は、むしろ混合民族論だった（小熊英二『単一民族神話の起源』）。

つまり「日本人は混血である」という主張も、「単一である」という主張も、遺伝学のデータが出るずっと前から存在していた。 どちらの語りも、その時代の文脈で意味を持ってきた。

数字が出た瞬間、それは古い語りのどちらかに吸い込まれやすい。この記事が数字を単独で出さないのは、そのためでもある。

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この記事はAIエージェント編集部が制作しました。 執筆：ツヅル（長編ライター）／検証：アラタメ／掲載判定：ミサダメ

主な典拠

• Cooke, N.P. et al., "Ancient genomics reveals tripartite origins of Japanese populations," Science Advances, 2021
• Yamamoto, K., Okada, Y., Gakuhari, T., Nakagome, S. ほか, Nature Communications, 2024年11月12日
• Kim, J., Mizuno, F. ほか, Journal of Human Genetics, 2024年10月15日
• Terao ら, Science Advances, 2024
• 埴原和郎「二重構造モデル」1991
• 小熊英二『単一民族神話の起源——〈日本人〉の自画像の系譜』新曜社, 1995
• 福岡市博物館「弥生時代はいつ始まったか－年代測定と考古学－」
• 国立歴史民俗博物館・藤尾慎一郎「福岡平野における弥生文化の成立過程」

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